建有机肥厂首先要确定我们使用哪种原料，能使用哪种原料。适合做有机肥的原料很多，要选择合适的堆肥原料，首先要了解各种原料的基本性质，特别是适一些适合产业化、商品化生产的特性，例如来源是否广泛、稳定，原料的各项养分指标是否满足制作肥料的要求，原料是否能够快速腐熟等。如：牲畜粪便、家禽粪便、作物秸秆和残渣、饼粕、中药渣、粉煤灰、树皮木屑和刨片、花生壳、麦麸等。
一般而言，堆肥原料的运输距离不超过100KM，所以有机肥厂应尽量在本地寻找合适的有机肥原料。按照使用量来划分，可以分为主料和辅料两种类型。
1、主料
主料就是有机肥生产的主要原料，通常这类原料占物料比例的30%~80%，主料一般由一种或者几种原料组成，常用的有畜禽粪便、市政污泥、草炭等。
2、辅料
辅料主要是用来调节物料水分、C/N、pH值、通透性的一些原料，由一种或几种原料组成，通常这类原料占整个物料比例不超过40%，单一物料比例不超过20%，常用的辅料有秸秆粉、稻壳粉、稻糠、麦麸、饼粕、蘑菇渣、粉煤灰、生石灰、过磷酸钙、磷矿粉等。
如按照原料性质划分，可以分为碳原料、氮原料和调理剂类原料等类型。
1、碳原料
是指那些有机碳含量高的原料，这类原料可以作为堆肥的主料，如秸秆大多是作为辅料，用来调节水分、C/N和增强肥料发酵的透气性，单应尽量减少使用稻壳，因为稻壳发酵后很难粉碎。
2、氮原料
通常是指那些C/N值在30以下的原料，这类原料可作为堆肥的主料，如畜禽粪便、市政污泥、甘蔗滤泥等；而又一些作辅料用来调节C/N的高氮原料，如鱼粉、稻壳粉、稻糠、草炭、粉煤灰等。
3、调节剂和膨胀剂
主要是指加入到有机肥种用来调节原料混合物的性质，如pH值、水分、质地、C/N，基质的结构和通气性等。
总之、有机肥生产应该根据当地的资源状况以及堆肥化的目的首先确定主料，然后根据主料的性质选取辅料。当主料为高碳原料时，应该选择合适的高氮原料进行调节；当主料为高氮原料时，应该选择合适的高碳原料进行调节。无论是何种原料，选用的一般原则是：（a）原料来源广泛、供应稳定；（b）原料水分尽量偏低；（c）氮、磷、钾及有机质养分适宜；（d）易腐熟；（e）成本或价格低。
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